O PPGCIMES possui, como espaços de formação para além da sala de aula, dois laboratórios voltados, principalmente, para a formação de recursos humanos e realização de pesquisas aplicadas a ensino. Neles, os discentes podem colaborar com os projetos de pesquisa, ensino, extensão, desenvolvimento e inovação coordenados pelos docentes e orientadores, aprimorando suas propostas de dissertação e produto, bem como suas qualificações acadêmica e profissionais.
Nesses laboratórios, atuam, conjuntamente, profissionais e pesquisadores de diferentes níveis de formação e áreas de atuação. Os laboratórios são integrados às coordenadorias pertencentes a estrutura organizacional do NITAE², conforme descrito a seguir:
1. Laboratório de Inovação em Tecnologias de Ensino
Integrado a Coordenadoria de Inovação em Tecnologias de Ensino (CITE) do NITAE². Suas finalidades são conceber e desenvolver programas de uso potencializado das tecnologias, projetos de pesquisas básicas e aplicadas, inter-multi-transdisciplinares, voltadas à proposição de soluções tecnológicas; desenvolver processos e produtos de projetos em Tecnologia da Informação e explorar criativamente o uso e a implementação de tecnologias e softwares inovadores no ensino–aprendizagem, repositórios e ambientes virtuais de aprendizagem.
2. Laboratório de Pesquisa e Experimentação em Multimídia
Integrado a Coordenadoria de Pesquisa Aplicada e Extensão (CPAE) do NITAE². Atua na concepção, experimentação e desenvolvimento de recursos e estratégias comunicacionais voltados para a educação, aliando teoria e prática na construção de conhecimentos. O espaço se configura como ambiente de diálogo entre profissionais, alunos de graduação e pós-graduação, professores e pesquisadores de diferentes áreas do conhecimento para atuarem de maneira integrada e multidisciplinar.